La costa oriental presenta una extensa barrera arrecifal  de unos 32 kms, que se extiende desde la altura de Smooth Water Bay– región suroriente de la isla hasta sobrepasar la isla de Santa Catalina.

El complejo arrecifal ocupa desde aproximadamente 1 kilómetro al sureste de Old Providence hasta cerca de 11 kilómetros al norte. Esta barrera arrecifal es considerada la más extensa de Colombia y la segunda en el Caribe, es uno de los arrecifes más significativos del Hemisferio Occidental. Las Islas son de origen volcánico con características de topografías escarpadas a excepción de una estrecha plataforma litoral o costera de naturaleza coralina solo por el lado sur occidental. La ubicación geográfica de las islas, determina tanto el clima, como el tipo de comunidades faunísticas y florísticas que se desarrollan en ellas, las cuales son claramente notorias por su dinámica de colores y sus variadas formas.

Las aguas de la barrera arrecifal son de una transparencia extraordinaria, como quiera que poseen visibilidad de 30 metros, una de las mejores del mundo para ejercer actividades de buceo, contemplativo, científico y deportivo.